实验室集中了价值约1.3亿元的仪器设备，由专职技术人员进行集中管理，维护保养，并对外开放共享。目前所管理的设备，包括各种型号的声学多普勒海流计约190台，具有采取水样功能的大型2套，温盐深仪和多参数水质仪473台，浅水和深水声学释放器105台，浮潜标11套，遥感现场观测设备10台，辅助导航通讯设备42台，泥沙观测设备8台，自主观测平台5套，能够满足实验室在不同海区同时开展各种大型的海洋大面调查和锚系长期观测的需要。除了这些常规仪器设备外，实验室还引进了水下滑翔机、波浪滑翔器、湍流测量仪，ARGO浮标、（S、C、L、Ku）四波段波导测量系统、频谱分析仪、信号发生器等先进的新型测量设备，开展创新性工作。在大量进口各种先进仪器设备的同时，实验室还根据自身需求，自主研发和改造仪器设备，近年来研制成功了深海内波浮标观测系统、声层析系统和防渔船拖网系统，并对各种仪器设备的供电电池进行改造，使实验室提高了在台风等恶劣天气频发，航运、渔业等人类活动活动频繁的海区获取连续的长时间观测资料的能力。（http://instruments.sio.org.cn/）